A limpeza e modelagem do sistema de canais radiculares são etapas fundamentais para o sucesso da terapia endodôntica e apresentam-se desafiadoras na região apical. O objetivo deste trabalho foi comparar, ex vivo, a capacidade de debridamento dos sistemas WaveOne Gold (Medium 35/.06) e TruNatomy (Medium 36/.03) no terço apical de canais circulares após instrumentação mecanizada. Quarenta e oito pré-molares inferiores foram divididos em três grupos (n = 16): Grupo C: Controle (sem instrumentação nem irrigação); Grupo WOG: WaveOne Gold (Glider 15/.02 e Medium 35/.06); Grupo TN: TruNatomy (Orifice Modifier 20/.08; Glider 17/.02 e Medium 36/.03). Os volumes totais dos irrigantes utilizados por canal radicular em todos os grupos experimentais foram 40 mL de hipoclorito de sódio (NaOCl) a 2,5% e 5 mL de ácido etilenodiamino tetra-acético (EDTA) a 17%. Em seguida, secções transversais em série de 0,5 micrômetros (?m) foram obtidas a cada 0,2 mm de um segmento de 2 mm da região apical, estendendo-se desde 1 até 3 mm aquém do a?pice radicular, totalizando 10 secções por espécimes. As secções foram dispostas em lâminas de vidro e coradas com hematoxilina e eosina. Após o processamento dos espécimes e a análise de todas as secções histológicas em microscópio digital (10x), as porcentagens de paredes não tocadas e detritos remanescentes foram quantificadas utilizando-se o software ImageJ. Modelos lineares generalizados foram utilizados para avaliar os efeitos dos diferentes protocolos utilizados. As análises foram realizadas no programa R, com nível de significância de 5%. Os resultados mostraram que os grupos WaveOne Gold e TruNatomy apresentaram porcentagens mais baixas de paredes não tocadas e detritos remanescentes do que o grupo controle (p<0,05). Não houve diferença estatisticamente significativa entre os grupos WaveOne Gold e TruNatomy quanto à porcentagem de paredes não tocadas e detritos remanescentes (p>0,05). Concluiu-se que a instrumentação com os sistemas WaveOne Gold Medium e TruNatomy Medium proporcionou porcentagens equivalentes de paredes não tocadas e detritos remanescentes em canais circulares de pré-molares inferiores. Ver menos