A eliminação de microrganismos do terço apical é crucial para o sucesso do tratamento endodôntico. O objetivo deste estudo é avaliar a influência de diferentes conicidades de preparo na redução de bactérias planctônicas e biofilme de Enterococcus faecalis e Candida albicans no terço apical (4 mm) de raízes mesiais de molares inferiores, relacionando a descontaminação com a formatação do canal. Após análise em microtomografia computadorizada para a padronização morfológica dos canais, quarenta e oito raízes com dois canais mesiais cada (96 canais) foram contaminadas com Enterococcus faecalis e Candida albicans e divididas em quatro grupos (n = 11) para a instrumentação dos canais utilizando as limas ProDesign Logic 2 com diferentes conicidades: # 25.03; # 25.04; # 25.05 e # 25.06 e irrigação com hipoclorito de sódio 2,5%. Quatro raízes foram avaliadas em microscopia eletrônica de varredura (MEV) para analisar qualitativamente a formação de biofilme. Oito raízes foram alocadas como grupo controle negativo. As amostras bacteriológicas foram coletadas exclusivamente do terço apical das raízes antes (S1) e após (S2) o preparo químico-mecânico e a contagem bacteriana realizada utilizando UFC/mL. Através do escaneamento final em micro-CT foram quantificadas a variação do volume e a área não preparada do canal no terço apical. Os testes utilizados para dados microbiológicos foram: Kruskal-Wallis, Student-Newman-Keuls e Wilcoxon, dados de micro-CT: ANOVA e testes de Tukey ou de Games-Howell e para correlações: Spearman (?=5%). Todos os grupos apresentaram significativa redução bacteriana (p < .05), sem diferença estatística significante. Nenhuma diferença estatística foi observada entre os grupos em relação ao aumento percentual de volume. A área não preparada ( %) foi afetada pela lima utilizada (p = 0,026), tendo sido significativamente menor no grupo 25.06 comparado ao grupo 25.03. Não houve correlação estatisticamente significativa entre a redução bacteriana, o volume e área não preparada (p > .05). Conclui-se, nas condições deste estudo, que diferentes conicidades de preparo influenciaram a formatação do canal radicular no terço apical, mas não melhoraram a descontaminação desta região. Ver menos